金树仁（1879年—1941年），字德庵，汉族，甘肃省河州人，民国时期新疆军阀。
金树仁1879年生于甘肃省。1914年至新疆省任知县，1926年被杨增新任命为新疆省民政厅长。1928年7月，杨增新遭军务厅长樊耀南刺杀身亡后，掌握军队的金树仁随即出兵讨伐樊耀南并逮捕之，同年11月17日，国民政府正式任命金树仁为新疆省主席。
金树仁统治新疆期间，政府官员多用汉人及其亲信，施政及管理上也一反杨增新的怀柔作风，处处对百姓实施压迫与剥削，尤其是开徵屠畜税以及禁止麦加朝觐，最受穆斯林的强烈反弹。
此外，金树仁亦实施改土归流，废止了哈密自清朝以来即施行的土司制度，终于点燃了穆斯林的反抗之火。1931年，哈密地区的穆斯林首先起兵反抗，并推举和加尼牙孜为领导，同时在马仲英的介入下，吐鲁番与和阗也相继发生穆斯林的反抗活动。
在接连不断的战乱烽火中，反对金树仁的人越来越多。1933年4月12日，新疆省参谋处长陈中、迪化城防指挥官白受、航空学校校长李笑天、迪化县长陶明樾等人，联合自东北撤退来的东北抗日义勇军残部（首领郑润成），以及自苏联-来的白俄归化军（首领巴品古特），共同发动了军事政变，占领了迪化，并推教育厅长刘文龙为临时省主席。
金树仁试图举兵-，却因盛世才的叛变而败走塔城。同年4月24日，金树仁宣布下野，随即逃往苏联，经由西伯利亚回到国民政府所在地南京。1935年返回甘肃兰州，1941年去世。
金树仁在史上的评价普遍不高，相对于杨增新对于新疆的经营，金树仁统治新疆期间，其政府腐败而蛮横，他甚至于让杨增新好不容易才缓和下来的汉回冲突，又再度爆发了出来，造成新疆的动荡与不安。