士孙瑞(?～195年)，字君策（《三辅决录》曰“瑞字君荣”），扶风(治所槐里，今陕西兴平市东南)人。中平五年(188)，王国等领兵围攻陈仓(今陕西宝鸡市东)，京兆尹盖勋进表，以他为鹰鹞都尉。
初平元年(190)，董卓挟迫汉献帝迁都长安，自己暂留洛阳。司徒王允见其挟天子以号令天下，且渐露篡逆之心，便与执金吾士孙瑞，司隶校尉黄琬，尚书郑公业等密谋，计划除掉董卓。士孙瑞出任南阳太守，与行左将军事的杨瓒一并领兵出武关(在今陕西商洛东南)，打着征讨袁术的名义，实则准备攻击董卓。此举引起了董卓的怀疑，军队被留住，此事未成。士孙瑞后任尚书仆射之职。初平三年(192)春季，长安连下了六十多天雨，他与王允等人借登台乞晴的机会，重新聚集，商定诛杀董卓的计策。四月辛巳，汉献帝病愈，大会群臣，董卓入朝庆贺，令吕布护卫左右，士孙瑞与王允密议后，自写诏书，授于吕布，命吕布杀掉了董卓。
诛杀董卓之后，他不居功自傲，不接受汉献帝的封赏。董卓的郎将李傕、郭汜叛乱，攻破长安，王允等被杀，而他却能幸免。
士孙瑞博学多才，德高望众，又做过国三老、光禄大夫、卫尉等职，朝中三公每有空缺，杨彪、皇甫嵩等都推举他。
兴平二年(195)十一月，在随汉献帝返回洛阳的途中与反叛的骠骑将军张济及李傕、郭汜的军队交战，兵败被杀，同时被杀的还有光禄勋邓泉、廷尉宣播、步兵校尉魏桀、侍中朱展、射声校尉沮俊等人。汉献帝到了许县(今河南许昌市东)追论其功绩，封其子士孙萌为津亭侯。
《隋书·经籍志》载：士孙瑞有文集二卷。