孙凝晖，1968年3月15日出生于上海普陀区，男，汉族，计算机系统结构专家，中共党员。1989年毕业于北京大学计算机系，1999年获中国科学院计算技术研究所博士学位。现任中国科学院计算技术研究所所长，中国计算机学报主编。
他长期从事高性能计算机研究工作，牵头研制了曙光2000到曙光6000三代曙光机群系列高性能计算机，在石油勘探等国家关键行业打破国外厂商垄断，并进入众多行业广泛应用。他发展了机群访存的技术体系，还提出了高通量计算的基础理论，为我国发展计算机体系结构技术做出了重要贡献。他以第一完成人获国家科技进步二等奖4项，发表重要论文160余篇，获2项国际顶级会议最佳论文奖，授权发明专利30项，获1项国家专利金奖。他获得国家杰青项目资助，现担任计算机体系结构国家重点实验室主任。
2019年当选中国工程院院士。