季芝昌（1791～1861），原名震，字云书，一字号仙九，别署丹魁堂主。江苏常州府江阴县青阳季家库（今桐岐乡）人。清道光十二年（1832）壬辰科吴钟骏榜进士第三人。
季芝昌的父亲季麟是直隶巨鹿知县，为官慈惠，在嘉庆十八年捕-而将籍册焚烧，使数以千计的人未被株连，可他本人由于捕匪不得力被发配，死于伊犁。季芝昌道光六年（1826）中举，凭举人身份，先后考取了国子监学正，学录及助教。考中探花后，授职翰林院编修。
道光十三年，季芝昌大考一等，名列第三，超升为侍读，提督山东学政。道光十七年，季芝昌为日讲起居注官。道光十八年，他以侍读衔充任会试同考官。道光十九年，季芝昌又大考一等，复列第三，升为詹事府少詹事。具折入谢，道光帝召见谕曰：“汝卷本是第一，朕不知何移置第三，然第一不若第三巧合上次名数”因而大笑。（三次在朝中考试钧得第三，也应季芝昌的字号仙九的“九”）尚书纪恩诗：“九重知己温言逮，三度同符盛事传”又升为詹事，任江西乡试主考。次年，季芝昌提督浙江学政，曾国藩等出其门下。升为内阁学士兼礼部侍郎衔。后丁母忧。期满，擢升内阁学士。道光二十三年，季芝昌充任阅卷大臣、礼部右侍郎，提督安徽学政。后调任吏部右侍郎。次年转为左侍郎。道光二十六年，因御门误班，被夺俸禄四年。道光二十七年，季芝昌充任会试知贡举，历任户部左侍郎、武英殿副总裁，经筵讲官。
道光二十八年，季芝昌调为仓场侍郎。他发现通坝这个粮食总交汇处有很大弊端，浮开所存底账作为用费就是其中之一。他上奏：“请漕督，细开通坝用账，不许有点滴不实，严于管理。” 季芝昌还发现在长芦盐场及相关盐务，有私盐侵渔、加斤计利等现象。他上奏这些弊端现象，主张尽改票盐，先税课后引用，对于天津府库进行妥善管理。季芝昌一一如实向上禀告。同年，季芝昌巡视海口炮台。道光二十九年，他又与耆英大学士赴浙江阅兵，并筹办盐务。制定浙江仓库钱粮赔补章程，对于任意挪用及亏缺，严于追补，原亏银额，务必追回，就是用自家房屋、什物做抵押，也不能侥幸逃避。他还着力于节省浮费，裁减冗员。不久，季芝昌出任山西巡抚。接着，被召进京，在吏部任右侍郎，军机大臣行走，升为户部左侍郎。道光三十年，季芝昌做为实录馆副总裁，修撰《宣宗成皇帝实录》，升都察院左都御史，赐紫禁城骑马。又任实录馆总裁之职。
咸丰元年，季芝昌出任闽浙总督，得咸丰帝谕旨：“凡应整顿者，顺渐次办理，不可性急”“事事惟知一实字，汝还朕亦一实字。慎勉为之，以副委任。”季芝昌对当地盗贼多次剿灭。首先，他督水师分头截击海盗布兴有等团伙，盗匪畏罪投诚，季芝昌将他们分别安插在保甲中。同时，普查当地船户、棚民。其次，他恩威并施，使浙江巡抚越剿越-、已成蔓延的滋事得以平息。在此期间，咸丰帝认为季芝昌办事恰到好处，将闽浙兵师任由季芝昌相机调用。最后，将首恶正法，使地方安定下来。季芝昌上奏：请将投诚的广海盗布兴有等，分回广东，酌量安插分拨各营，戴罪立功。咸丰帝准其奏请。次年，季芝昌兼任福州将军，因地方安定而赏戴花翎。此外，他上奏：因地而异，立法稽查，设盐务章程，官私两利，有益于大局。这一抚恤商贾、课税丰裕的谏言奏章被咸丰帝批准。
季芝昌针对“户部请推广捐钱获举人、附生”一事，与福建巡抚王懿德联合上奏：“读书应试要按国家需要而定额，严格录取科名才受到足够重视，无才能的人不能混入其中。而一旦扩大捐钱获科名的先例，则朝中减少良才而且使学业荒疏的心存侥幸的冒进，却伤了贤士上进之心。对于国家官吏治理有害无利，对于朝廷求贤也是损失。”季芝昌对于捐钱获科名的利害，分析得十分深刻。
咸丰二年，季芝昌专门任命徐宗干绥靖台湾。而后，向上奏报，将台湾嘉义歃血结盟、竖旗滋事的首要头领擒获。季芝昌按咸丰帝令不要漏掉一名，又普遍进行搜捕。此期间，季芝昌密保叶绍春以办洋务；而后，又提出严禁盐商代销官运。季芝昌再一次上奏整饬盐务的奏章：“以往盐务不像商办那样，先交税然后再做买卖。因此，买卖销售阻滞，而税收也无着落。于是代销、帮销等种种通融之事屡屡发生。官商两种不同税收，使各个商人追逐其中利益。考虑此情况，务必革除代销，保证官税按引讷课。”年底，季芝昌因病告请辞官。在这一年，他曾上奏：琉球请撤英人，向英使交涉一事。由于他捐备军饷，咸丰帝赏戴花翎。咸丰三年，季芝昌回乡办理团练。
咸丰十年（1860），季芝昌去世，卒年70岁。葬于江阴长山高台。光绪二年，时任闽浙总督的文煜奏言：季芝昌剿海盗，整吏治，尚清廉，疏河道，革盐务之陋规等种种善政，为民称颂。光绪帝赐季芝昌谥号文敏。
著有《丹魁堂全集》七卷、《感遇录》等。